Keberadaan Program Doktor Program Studi Pendidikan Agama Islam (PAI) Universitas Islam Negeri Sultan Aji Muhammad Idris Samarinda di wilayah Kaltim-Tara akan memiliki warna tersendiri bagi pengembangan Pendidikan Agama Islam. Di wilayah ini, terdapat beberapa perguruan tinggi negeri dan swasta yang akan mendukung bagi eksistensi dan pengembangan Program Doktor Program Studi Pendidikan Agama Islam (PAI) Universitas Islam Negeri Sultan Aji Muhammad Idris Samarinda. Banyaknya Perguruan Tinggi Keagamaan Islam (PTKI) swasta yang diwilayah ini, membutuhkan lembaga perguruan tinggi yang mampu memfasilitasi pengembangan sumber daya manusia (SDM) terutama dosen dalam menempuh studi lanjut. Oleh karena itu, dengan dibukanya Program Doktor S3 Pendidikan Agama Islam (PAI) Universitas Islam Negeri Sultan Aji Muhammad Idris Samarinda, akan memberikan kemudahan bagi para dosen, pendidik dan praktisi pendidikan untuk melanjutkan studi.
